南北朝時，中印佛教僧侶往來頻繁。我國求法印度的僧徒大都精通藥學。如公元六世紀，高僧宋云就向印度人介紹了華佗的醫療事跡。唐代僧人曾在印度居住二十年，用藥學為印度人診治疾病，并介紹、宣傳中醫藥學，如本草學、脈學、延年益壽術等知識，促進了中印醫藥學的交流。

我國向印度傳入藥物的時間較早，品種也較多。如人參、茯苓、當歸、烏頭等，被印人譽為“神州上藥”。我國與印度的交通主要是海運，通過海運的藥物貿易也十分興旺，不少藥物傳入印度后，又再傳入阿拉伯地區。如十三世紀阿拉伯藥物學家伊本·巴伊塔爾《藥草志》中就提到印度有一種叫使君子的藥物，來自中國，經印度傳入阿拉伯地區，是驅小兒蛔蟲的良藥。

最早將印度醫學傳入中國的是東漢末年，伊朗國王滿屈二世的王子、佛教徒安世高。南北朝時，印度醫藥隨佛教書籍傳入中國，到中國的印度人也大多懂得醫術，唐時有印度醫生來華行醫。鑒真大師就曾請印度醫生治療眼病。公元713年，婆羅門僧人曾向唐明皇獻長生藥仙茅方。在《外臺秘要》、《千金方》等醫書中收錄了印度的方藥和治療方法。如阿伽圓方、耆婆治病丸、耆婆治惡病方等十余首方劑及天竺按摩術、天竺經論眼等治療方法。在《隋書·經籍志》中收錄已被翻譯成中文的古印度醫書就有《婆羅門藥方》、《龍樹菩薩藥方》等十余種數十卷。

自南北朝開始，歷代都有印度的藥物如龍腦香、象牙、石蜜、犀角等或通過饋贈或作為貢品或成為貿易商品傳入我國。古印度醫學傳入我國后，陶弘景、巢元方、孫思邈等醫家曾試圖用印度醫學理論和中醫學理論相匯通的觀點，闡明中醫學理論。

古印度醫學病理學的主要內容是“四大說”，即地水風火。“大”之義為氣，認為“一氣不調，百一病生，四氣不調，合生四百四病”。“四大說”成為了古代中印醫學匯通嘗試的醫家解釋病理的基礎。

孫思邈根據古印度醫學的“四大說”與中醫學的病因學，提出了發生疾病的原因有四種：第一種為冷，第二種為氣痰，第三種是邪風，第四種是熱毒之邪的匯通發病學觀點。孫氏還把中醫臟腑學說與古印度醫學理論進行了匯通，指出：百種疾病離不開五臟，五臟各有八十一種疾病，冷熱風氣四種病因，共產生四百零四種疾病。孫氏把古印度名醫耆婆關于天下物類皆是靈藥，萬物之中無一物而非藥者的觀點，匯通中醫藥學后，不但影響了孫氏的臨證實踐，而且對后世中藥學的發展也產生了大的影響。李時珍在《本草綱目》中就明確提出了天下無一物不可以為藥的思想和觀點。

古印度醫藥學傳入中國后，盡管有些醫家對它們進行了研究與匯通的嘗試，但古印度醫學理論沒有對中醫藥學產生較大的影響，只從不同的側面豐富了中醫藥學。古印度的藥物則成為了中藥學的一個組成部分，它們大都收錄到了唐朝以后的歷代本草著作中，并完全中醫藥化了。