李時珍經過長期的臨床實踐，認識到本草“關系頗重”，而古代本草中“差訛、遺漏不可枚數”，為了糾偏正誤，他不恥下問，虛心向勞動大眾求教;為了考察藥物的形態、生長、性能，他不惜遠涉千山萬水，足跡遍及大江南北。

李時珍對宋代蘇頌《圖經》中的老鴉眼睛草與龍珠之考證即為一例。李時珍曰：“、龍珠，一類兩種也，皆處處有之。四月生苗，可食，柔滑……但生青熟黑者為，生青熟赤者為龍珠，功用亦相仿佛，不甚遼遠。楊慎丹鉛錄，謂即吳葵，反指本草為誤，引素問、千金四月吳葵華為證。蓋不知千金方言吳葵即蜀葵，已自明白矣。今并正之。”李時珍的這一段敘述不僅將、龍珠作了歸并，辨正了《圖經》老鴉眼睛草與各立一條之誤，還辨正了楊慎即吳葵之失。論述透徹、明確，使、老鴉眼睛草、龍珠、吳葵、蜀羊泉等之間混亂的名稱得以厘正。

古代本草常將與相互混淆，或將兩者視為一物。李時珍以認真負責的科學態度糾正了前人的這一錯誤。《神農本草》之，《本草綱目》釋名為五代南唐陳士良《食性本草》之。時珍曰：“有細細孔，兩頭皆通，故名，即今所謂也。今之，乃古之通脫木也，宋本混注為一，今分出之”。他在“集解”項作了進一步詳釋，“其枝今人謂之，有紫、白二色，紫者皮厚味辛，白者皮薄味淡。本經言味辛，別錄言味甘，是兩者皆通利也。”

、土是古今長期混亂品種，李時珍在《本草綱目》中曰：“土，楚蜀山箐中甚多，蔓生如莼，莖生細點，其葉不對，狀頗類大而質厚滑，如葉而長五六寸，其根如而圓，其大如雞鴨子，連綴而生，遠者離尺許，近或數寸，其肉軟，可生啖。有赤白二種，入藥用白者良。”生動簡要地描述了土原植物的特征：苓蔓生，葉狀如，大而質厚。根狀莖細長，每隔一段間距生一肥厚的塊狀結節，這與科植物土(光葉)的特征完全吻合。特別是說“赤白”二種，真實無誤，因其生長環境質地的差別，雖同種植物，亦有赤白之分。李時珍不但對藥物標本及性狀進行研究，而且還將研究結果與古文獻進行比照考證。他說：“按中山徑云，鼓鐙之山有本草焉，名曰榮草，其竹如柳，其本如雞卵，食之已風，恐即此也。”并找到“食之已風”的療效。他還說：“諸醫無從考證，往往指為萆?Z及，然其根苗迥然不同，宜參考之。但其功用亦頗為相近，蓋亦萆、之類也。”李時指出古代醫家對此無從考證和相互混淆的藥物加以訂證和區分。

李時珍通過漫長實踐與考證，互相比照區分，才得出以上真知灼見，在消除諸多藥物品種長期混亂方面做出了杰出的貢獻。